Внешний вид -> Твой_Скин -> globalTemplate
Находишь:
<!--c1--><div class='codetop'>Код</div><div class='codemain'><!--ec1--></body><!--c2--></div><!--ec2-->
И перед вставляешь коды счетчиков:
<!--c1--><div class='codetop'>Код</div><div class='codemain'><!--ec1--><div align='center'>счетчики</div><!--c2--></div><!--ec2-->