Вобщем я тоже столкнулся с тем, что уехали меню в левую сторону после добавления баннера.
Что бы этого избежать я просто вставил под этот код вот это
<!--c1--><div class='codetop'>Код</div><div class='codemain'><!--ec1--><div style="clear:both;"></div><!--c2--></div><!--ec2-->
Итог будет таким
<!--c1--><div class='codetop'>Код</div><div class='codemain'><!--ec1--><div id="logostrip">
<div style='float:right;padding:5px'>
<a href="#" target="_blank"><img src='путь к картинке' border='0' /></a>
</div>
<a href='{$this->ipsclass->base_url}'><!--ipb.logo.start--><img src='style_images/<#IMG_DIR#>/logo4.gif' style='vertical-align:top' alt='IPB' border='0' /><!--ipb.logo.end--></a>
</div>
<div style="clear:both;"></div><!--c2--></div><!--ec2-->
Что бы этого избежать я просто вставил под этот код вот это
<!--c1--><div class='codetop'>Код</div><div class='codemain'><!--ec1--><div style="clear:both;"></div><!--c2--></div><!--ec2-->
Итог будет таким
<!--c1--><div class='codetop'>Код</div><div class='codemain'><!--ec1--><div id="logostrip">
<div style='float:right;padding:5px'>
<a href="#" target="_blank"><img src='путь к картинке' border='0' /></a>
</div>
<a href='{$this->ipsclass->base_url}'><!--ipb.logo.start--><img src='style_images/<#IMG_DIR#>/logo4.gif' style='vertical-align:top' alt='IPB' border='0' /><!--ipb.logo.end--></a>
</div>
<div style="clear:both;"></div><!--c2--></div><!--ec2-->